Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA1P29973 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNGA1P29973 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA1P29973 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA1P29973 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms