Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNE1P24864 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNE1P24864 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms