Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAG1P15918 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAG1P15918 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAG1P15918 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAG1P15918 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAG1P15918 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RAG1P15918 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG1P15918 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG1P15918 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG1P15918 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG1P15918 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG1P15918 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG1P15918 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG1P15918 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG1P15918 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG1P15918 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAG1P15918 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAG1P15918 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAG1P15918 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAG1P15918 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAG1P15918 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAG1P15918 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAG1P15918 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAG1P15918 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RAG1P15918 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAG1P15918 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAG1P15918 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAG1P15918 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAG1P15918 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAG1P15918 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAG1P15918 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAG1P15918 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAG1P15918 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAG1P15918 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAG1P15918 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAG1P15918 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAG1P15918 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAG1P15918 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAG1P15918 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAG1P15918 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAG1P15918 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAG1P15918 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAG1P15918 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAG1P15918 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAG1P15918 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAG1P15918 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAG1P15918 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAG1P15918 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAG1P15918 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAG1P15918 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAG1P15918 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAG1P15918 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAG1P15918 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAG1P15918 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAG1P15918 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAG1P15918 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAG1P15918 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAG1P15918 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RAG1P15918 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAG1P15918 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAG1P15918 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAG1P15918 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAG1P15918 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAG1P15918 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAG1P15918 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAG1P15918 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAG1P15918 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAG1P15918 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAG1P15918 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAG1P15918 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAG1P15918 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAG1P15918 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAG1P15918 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAG1P15918 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAG1P15918 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAG1P15918 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAG1P15918 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAG1P15918 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAG1P15918 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAG1P15918 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAG1P15918 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms