Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2F2P13984 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2F2P13984 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2F2P13984 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms