Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR35P0CG20 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR35P0CG20 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms