Protein–RNA interactions for Protein: P09619

PDGFRB, Platelet-derived growth factor receptor beta, humanhuman

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Length 1,106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRBP09619 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFRBP09619 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDGFRBP09619 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFRBP09619 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFRBP09619 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFRBP09619 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFRBP09619 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDGFRBP09619 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRBP09619 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRBP09619 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRBP09619 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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