Protein–RNA interactions for Protein: P08651

NFIC, Nuclear factor 1 C-type, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFICP08651 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFICP08651 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFICP08651 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFICP08651 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFICP08651 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFICP08651 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFICP08651 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFICP08651 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFICP08651 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFICP08651 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFICP08651 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFICP08651 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFICP08651 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFICP08651 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFICP08651 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFICP08651 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFICP08651 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFICP08651 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFICP08651 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NFICP08651 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFICP08651 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFICP08651 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFICP08651 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFICP08651 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFICP08651 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFICP08651 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFICP08651 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFICP08651 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFICP08651 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFICP08651 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFICP08651 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFICP08651 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFICP08651 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFICP08651 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFICP08651 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFICP08651 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFICP08651 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFICP08651 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFICP08651 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFICP08651 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFICP08651 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFICP08651 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFICP08651 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFICP08651 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFICP08651 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFICP08651 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFICP08651 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFICP08651 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFICP08651 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFICP08651 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFICP08651 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFICP08651 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFICP08651 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFICP08651 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFICP08651 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFICP08651 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFICP08651 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFICP08651 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFICP08651 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFICP08651 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFICP08651 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFICP08651 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFICP08651 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFICP08651 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFICP08651 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFICP08651 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFICP08651 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFICP08651 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFICP08651 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFICP08651 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFICP08651 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFICP08651 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFICP08651 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFICP08651 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFICP08651 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFICP08651 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFICP08651 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFICP08651 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFICP08651 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFICP08651 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFICP08651 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFICP08651 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFICP08651 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFICP08651 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFICP08651 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFICP08651 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFICP08651 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFICP08651 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFICP08651 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms