Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCXO43602 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCXO43602 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCXO43602 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DCXO43602 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCXO43602 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCXO43602 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCXO43602 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCXO43602 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCXO43602 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCXO43602 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCXO43602 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCXO43602 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCXO43602 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCXO43602 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCXO43602 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DCXO43602 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCXO43602 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCXO43602 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCXO43602 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCXO43602 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DCXO43602 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCXO43602 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCXO43602 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCXO43602 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCXO43602 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCXO43602 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCXO43602 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCXO43602 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DCXO43602 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCXO43602 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCXO43602 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCXO43602 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCXO43602 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCXO43602 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCXO43602 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCXO43602 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCXO43602 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCXO43602 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCXO43602 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCXO43602 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCXO43602 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCXO43602 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCXO43602 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DCXO43602 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCXO43602 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCXO43602 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCXO43602 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCXO43602 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCXO43602 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCXO43602 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCXO43602 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCXO43602 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCXO43602 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCXO43602 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCXO43602 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCXO43602 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCXO43602 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCXO43602 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCXO43602 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCXO43602 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCXO43602 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DCXO43602 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCXO43602 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCXO43602 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DCXO43602 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCXO43602 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCXO43602 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCXO43602 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCXO43602 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCXO43602 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCXO43602 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCXO43602 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCXO43602 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCXO43602 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DCXO43602 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCXO43602 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCXO43602 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCXO43602 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCXO43602 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCXO43602 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DCXO43602 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCXO43602 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DCXO43602 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCXO43602 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCXO43602 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCXO43602 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCXO43602 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCXO43602 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCXO43602 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DCXO43602 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms