Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNPHO15079 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNPHO15079 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNPHO15079 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNPHO15079 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNPHO15079 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNPHO15079 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNPHO15079 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNPHO15079 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNPHO15079 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNPHO15079 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNPHO15079 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNPHO15079 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNPHO15079 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNPHO15079 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNPHO15079 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNPHO15079 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNPHO15079 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNPHO15079 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNPHO15079 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNPHO15079 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNPHO15079 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNPHO15079 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNPHO15079 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNPHO15079 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNPHO15079 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNPHO15079 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNPHO15079 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNPHO15079 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNPHO15079 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNPHO15079 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNPHO15079 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNPHO15079 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNPHO15079 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNPHO15079 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNPHO15079 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNPHO15079 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNPHO15079 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNPHO15079 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNPHO15079 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNPHO15079 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNPHO15079 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNPHO15079 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNPHO15079 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNPHO15079 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNPHO15079 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNPHO15079 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNPHO15079 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNPHO15079 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNPHO15079 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNPHO15079 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNPHO15079 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNPHO15079 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNPHO15079 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNPHO15079 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNPHO15079 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNPHO15079 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNPHO15079 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms