Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SYNJ2O15056 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
SYNJ2O15056 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
SYNJ2O15056 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SYNJ2O15056 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SYNJ2O15056 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SYNJ2O15056 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms