Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GIPC1O14908 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GIPC1O14908 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GIPC1O14908 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms