Protein–RNA interactions for Protein: O00522

KRIT1, Krev interaction trapped protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRIT1O00522 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRIT1O00522 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRIT1O00522 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRIT1O00522 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms