Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TK2O00142 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TK2O00142 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TK2O00142 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TK2O00142 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TK2O00142 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TK2O00142 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TK2O00142 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TK2O00142 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TK2O00142 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TK2O00142 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TK2O00142 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TK2O00142 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TK2O00142 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TK2O00142 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TK2O00142 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TK2O00142 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TK2O00142 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TK2O00142 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TK2O00142 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TK2O00142 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TK2O00142 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TK2O00142 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK2O00142 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK2O00142 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK2O00142 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK2O00142 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK2O00142 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK2O00142 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK2O00142 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TK2O00142 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TK2O00142 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TK2O00142 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TK2O00142 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TK2O00142 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TK2O00142 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TK2O00142 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TK2O00142 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TK2O00142 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TK2O00142 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TK2O00142 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TK2O00142 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TK2O00142 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TK2O00142 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TK2O00142 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TK2O00142 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TK2O00142 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TK2O00142 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TK2O00142 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TK2O00142 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TK2O00142 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TK2O00142 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TK2O00142 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TK2O00142 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TK2O00142 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TK2O00142 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TK2O00142 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TK2O00142 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TK2O00142 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TK2O00142 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TK2O00142 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TK2O00142 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TK2O00142 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TK2O00142 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TK2O00142 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms