Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTAGE9A4FU28 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE9A4FU28 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms