Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POMPQ9Y244 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms