Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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