Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLUP10909 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLUP10909 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms