Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM48Q8IWZ4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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