Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETV4P43268 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETV4P43268 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETV4P43268 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ETV4P43268 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms