Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MMP11P24347 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MMP11P24347 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP11P24347 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MMP11P24347 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms