Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCHIP1Q9P0W5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms