Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms