Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms