Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN19Q8N6F1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CLDN19Q8N6F1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CLDN19Q8N6F1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN19Q8N6F1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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