Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEUROD1Q13562 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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