Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXM1Q08050 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms