Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX11P35716 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX11P35716 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX11P35716 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX11P35716 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX11P35716 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOX11P35716 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOX11P35716 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOX11P35716 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms