Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
A4D1N5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
A4D1N5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms