Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms