Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEDD1Q8NHV4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms