Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 CECR3-201ENST00000428828 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TSPYL6-201ENST00000317802 3089 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 PPP3CB-203ENST00000394828 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ZNF761-204ENST00000610928 938 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CD200-202ENST00000383681 1997 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TCF4-224ENST00000564403 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ABCD1-201ENST00000218104 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 GNPDA1-201ENST00000311337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 SLC12A4-203ENST00000537830 3525 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 LINC02453-201ENST00000501499 1825 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ARL3-201ENST00000260746 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 RSPH10B-203ENST00000405415 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ALAS1-201ENST00000310271 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TMEM19-204ENST00000549735 1772 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 AL441943.2-201ENST00000421077 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ZNF608-210ENST00000613878 3190 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ZNF700-203ENST00000622593 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 HSPE1P10-201ENST00000508631 558 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 MED7-201ENST00000286317 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 SLC5A11-209ENST00000567758 2246 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 STOML3-202ENST00000423210 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 TTPA-201ENST00000260116 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SVIPQ8NHG7 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms