RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.49■■□□□ 1.67
TTPA-201ENST00000260116 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.3■■□□□ 1.16
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TTPA-201ENST00000260116 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.52■■□□□ 1.04
TTPA-201ENST00000260116 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
TTPA-201ENST00000260116 NACADO15069 1562 aa20.91■□□□□ 0.94
TTPA-201ENST00000260116 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.9■□□□□ 0.94
TTPA-201ENST00000260116 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.89■□□□□ 0.93
TTPA-201ENST00000260116 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.79■□□□□ 0.92
TTPA-201ENST00000260116 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.79■□□□□ 0.92
TTPA-201ENST00000260116 SCRIBQ14160 1630 aa20.7■□□□□ 0.9
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TTPA-201ENST00000260116 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.99■□□□□ 0.79
TTPA-201ENST00000260116 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
TTPA-201ENST00000260116 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.77■□□□□ 0.76
TTPA-201ENST00000260116 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.76■□□□□ 0.75
TTPA-201ENST00000260116 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
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TTPA-201ENST00000260116 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.64■□□□□ 0.73
TTPA-201ENST00000260116 WIZO95785 1651 aa19.59■□□□□ 0.73
TTPA-201ENST00000260116 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.51■□□□□ 0.71
TTPA-201ENST00000260116 SMARCA2P51531 1590 aa19.4■□□□□ 0.7
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TTPA-201ENST00000260116 CFTRP13569 1480 aa18.83■□□□□ 0.6
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TTPA-201ENST00000260116 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.71■□□□□ 0.58
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TTPA-201ENST00000260116 ABCC8Q09428 1581 aa18.69■□□□□ 0.58
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TTPA-201ENST00000260116 PRDM2Q13029 1718 aa18.61■□□□□ 0.57
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TTPA-201ENST00000260116 CUX1P39880 1505 aa18.49■□□□□ 0.55
TTPA-201ENST00000260116 SYNJ1O43426 1573 aa18.48■□□□□ 0.55
TTPA-201ENST00000260116 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.46■□□□□ 0.55
TTPA-201ENST00000260116 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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TTPA-201ENST00000260116 TOPBP1Q92547 1522 aa18.44■□□□□ 0.54
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TTPA-201ENST00000260116 WDR62O43379 1518 aa18.37■□□□□ 0.53
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TTPA-201ENST00000260116 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.35■□□□□ 0.53
TTPA-201ENST00000260116 TOP2BQ02880 1626 aa18.35■□□□□ 0.53
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TTPA-201ENST00000260116 SOGA1O94964 1423 aa18.26■□□□□ 0.51
TTPA-201ENST00000260116 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
TTPA-201ENST00000260116 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TTPA-201ENST00000260116 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.22■□□□□ 0.51
TTPA-201ENST00000260116 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.21■□□□□ 0.51
TTPA-201ENST00000260116 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
TTPA-201ENST00000260116 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TTPA-201ENST00000260116 IFT140Q96RY7 1462 aa18.13■□□□□ 0.49
TTPA-201ENST00000260116 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.1■□□□□ 0.49
TTPA-201ENST00000260116 WDR97A6NE52 1622 aa18.08■□□□□ 0.48
TTPA-201ENST00000260116 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
TTPA-201ENST00000260116 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.04■□□□□ 0.48
TTPA-201ENST00000260116 KIF27Q86VH2 1401 aa18.03■□□□□ 0.48
TTPA-201ENST00000260116 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.01■□□□□ 0.47
TTPA-201ENST00000260116 FBLN2P98095 1184 aa18■□□□□ 0.47
TTPA-201ENST00000260116 IGF1RP08069 1367 aa17.97■□□□□ 0.47
TTPA-201ENST00000260116 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.95■□□□□ 0.46
TTPA-201ENST00000260116 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.95■□□□□ 0.46
TTPA-201ENST00000260116 PBRM1Q86U86 1689 aa17.95■□□□□ 0.46
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TTPA-201ENST00000260116 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.85■□□□□ 0.45
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TTPA-201ENST00000260116 ADAMTS12P58397 1594 aa17.82■□□□□ 0.44
TTPA-201ENST00000260116 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TTPA-201ENST00000260116 PRXQ9BXM0 1461 aa17.79■□□□□ 0.44
TTPA-201ENST00000260116 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.79■□□□□ 0.44
TTPA-201ENST00000260116 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TTPA-201ENST00000260116 CHD1O14646 1710 aa17.78■□□□□ 0.44
TTPA-201ENST00000260116 SYNJ2O15056 1496 aa17.77■□□□□ 0.44
TTPA-201ENST00000260116 CUL7Q14999 1698 aa17.75■□□□□ 0.43
TTPA-201ENST00000260116 GRIN2AQ12879 1464 aa17.74■□□□□ 0.43
TTPA-201ENST00000260116 KIF21BO75037 1637 aa17.68■□□□□ 0.42
TTPA-201ENST00000260116 CEP170Q5SW79 1584 aa17.68■□□□□ 0.42
TTPA-201ENST00000260116 GOLGA3Q08378 1498 aa17.67■□□□□ 0.42
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