Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGSF1Q8N6C5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms