Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDCL2Q8N4E4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms