Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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