Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
THOP1P52888 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
THOP1P52888 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms