Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms