Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 PIGF-203ENST00000412717 737 ntTSL 310.56□□□□□ -0.723e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RNF31-215ENST00000559491 478 ntTSL 210.54□□□□□ -0.723e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 SIL1-208ENST00000505945 250 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.743e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-216ENST00000488268 631 ntTSL 310.24□□□□□ -0.773e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 CEP164-203ENST00000525734 616 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.18□□□□□ -0.783e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 MED1-202ENST00000394287 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.064e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RNF167-210ENST00000574548 440 ntTSL 28.06□□□□□ -1.123e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 LINC02365-201ENST00000519173 473 ntTSL 38.02□□□□□ -1.133e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 LINC02365-203ENST00000522554 802 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.173e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 RNF31-222ENST00000560631 320 ntTSL 27.68□□□□□ -1.183e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ECHDC2-224ENST00000543419 555 ntTSL 37.66□□□□□ -1.183e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PIGF-204ENST00000420164 586 ntTSL 57.48□□□□□ -1.213e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.313e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 GIGYF2-231ENST00000474312 4687 ntTSL 26.68□□□□□ -1.343e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ITGB1-218ENST00000528877 546 ntTSL 46.59□□□□□ -1.353e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ITGB1-203ENST00000414670 500 ntTSL 36.06□□□□□ -1.443e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.463e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NAP1L4-215ENST00000528363 685 ntTSL 25.74□□□□□ -1.492e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.523e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 NFKB1-208ENST00000509165 557 ntTSL 55.47□□□□□ -1.534e-6■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ITGB1-219ENST00000534049 562 ntTSL 45□□□□□ -1.613e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 GIGYF2-213ENST00000426102 561 ntTSL 44.31□□□□□ -1.723e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.783e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 ITGB1-213ENST00000484088 580 ntTSL 43.17□□□□□ -1.93e-8■■■□□ 18.9
PCBP2Q15366 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.382e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 CNTNAP1-204ENST00000591662 4499 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.712e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.843e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.692e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.172e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.32e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 FAM222B-201ENST00000341217 4033 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 EYA3-206ENST00000471498 1806 ntTSL 1 (best)9.63□□□□□ -0.879e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 EYA3-201ENST00000373863 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.029e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 HDLBP-218ENST00000441124 708 ntTSL 217.25■□□□□ 0.357e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 HDLBP-212ENST00000426343 594 ntTSL 416.54■□□□□ 0.247e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 HDLBP-224ENST00000452065 996 ntTSL 510.68□□□□□ -0.77e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 HDLBP-217ENST00000430918 612 ntTSL 39.35□□□□□ -0.917e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 HDLBP-219ENST00000442714 569 ntTSL 49.31□□□□□ -0.927e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 CALM3-205ENST00000486500 2536 ntTSL 212.46□□□□□ -0.412e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 11e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.291e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.171e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.26e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 PPP2R1B-201ENST00000311129 2082 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.926e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.086e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.431e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 AP2A1-208ENST00000601356 2238 nt22.93■■□□□ 1.261e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.21e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ETS2-203ENST00000432278 1033 ntTSL 518.59■□□□□ 0.571e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 TCF25-216ENST00000565860 437 ntTSL 318.19■□□□□ 0.51e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 C17orf49-206ENST00000549857 2343 ntTSL 217.98■□□□□ 0.471e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.11e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 C17orf49-205ENST00000547747 430 ntTSL 315.12■□□□□ 0.011e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 C17orf49-204ENST00000547709 626 ntTSL 314.84□□□□□ -0.031e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.031e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-12■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 IVD-207ENST00000491554 1148 ntTSL 313.09□□□□□ -0.311e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 FOSL1-205ENST00000534222 584 ntTSL 312.45□□□□□ -0.423e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 SLC39A11-216ENST00000583715 589 ntTSL 511.17□□□□□ -0.621e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.341e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.381e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 POGZ-211ENST00000482678 568 ntTSL 36.02□□□□□ -1.451e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 MTAP-206ENST00000577563 339 ntTSL 1 (best)4.15□□□□□ -1.751e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 POGZ-215ENST00000495253 617 ntTSL 23.83□□□□□ -1.81e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 DNHD1-202ENST00000354685 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.772e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.442e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 SLC25A43-204ENST00000493093 896 ntTSL 319.02■□□□□ 0.644e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 SLC25A43-203ENST00000488158 2699 ntTSL 218.54■□□□□ 0.564e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.454e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 SLC25A43-202ENST00000484058 358 ntTSL 27.32□□□□□ -1.244e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 11e-9■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.82e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.772e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 COPS7A-218ENST00000543939 1728 ntTSL 319.49■□□□□ 0.712e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 COPS7A-202ENST00000455113 1718 ntTSL 316.82■□□□□ 0.282e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 COPS7A-203ENST00000534877 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.572e-8■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 PDLIM7-204ENST00000393546 671 ntTSL 318.07■□□□□ 0.483e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 PDLIM7-215ENST00000506161 759 ntTSL 315.58■□□□□ 0.083e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 PDLIM7-210ENST00000503827 451 ntTSL 514.75□□□□□ -0.053e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.094e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.24e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.324e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.324e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.964e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.024e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.084e-7■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ETV6-203ENST00000541426 572 ntTSL 416.55■□□□□ 0.243e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.713e-6■■■□□ 18.8
PCBP2Q15366 RNASEK-C17orf49-202ENST00000547863 1662 ntTSL 223.16■■□□□ 1.32e-10■■■□□ 18.8
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 115.3 ms