Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPN11Q06124 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms