Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRD1A4D1F6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms