Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms