Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FRMD6Q96NE9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms