Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNBD2Q96M20 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms