Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SPTAN1Q13813 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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