Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms