Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDH1P12830 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDH1P12830 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms