Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB39AQ14964 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms