Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHD4Q14839 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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