Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CD300CQ08708 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms