Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms